临床药理研究所面向郑州大学临床医学、口腔医学、麻醉医学、影像学、检验医学等各专业各层次的本科生和研究生开设《临床药理学》课程；面向研究生开设《科研文献阅读》、《科研文献剖析》、《科研评述》等。
临床药理研究所已形成的鲜明的教学特色。《临床药理学》系列教材建设是本科生教学的突出特色。从1989时的自编自用教材，到2000年初的多所院校协编同用，直至2010年主编的国家规划教材，历经近20多年，形成了带有郑州大学特色的《临床药理学》系列教材。研究生培养机制创新形成了“311”培养模式。即由精读文献100篇、剖析文献100篇、科研评述100次组成的“3个100”，由10次科研报告组成的“10”，以及1篇SCI论文代表的“1”，经过10多年的应用，研究生培养质量得到了的极大提高，多名研究生获得国家奖学金以及“刘昌孝院士优秀博士生奖”。另外，注重大学生科研能力的培养，主持完成了10余项大学生创新实验，取得了优异成绩，学生以第一作者发表JCR一区研究论文，并获得“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛河南省一等奖等。
