郑州大学临床药理研究所（河南医科大学临床药理学教研室）于1990年在原河南医科大学药理学教研室抗感染药理课题组基础上创建，由我国著名抗感染药理专家马统勋教授任首届主任，现任所长乔海灵教授于1994年接任。1997年在临床药理教研室基础上成立临床药理研究所。临床药理研究所是我校国家药品临床研究基地的主要发起和组成单位，为我校临床药理基地的建立和发展做出了突出贡献。
临床药理研究所是我国首批药理学硕士点，2006年成为博士点。目前是河南省重点学科、河南省创新型科技团队、郑州大学校级协同创新中心等。在40年药理学研究生培养过程中，已培养了100余名博士、硕士研究生，积累了较为成熟的培养经验，建立了较为完善的培养模式，大胆的进行了培养机制创新，首创了研究生培养的“311模式”，创设了《科研文献阅读》、《科研文献剖析》、《科研评述》等课程，为提高研究生培养质量奠定了基础。
临床药理研究所主要科研方向为临床药理研究，包括药物代谢与药物动力学研究、肿瘤等炎症相关性疾病靶点发现与防治研究等，旨在为临床个体化用药、以及肿瘤等炎症相关疾病防治提供依据。在药物代谢与药物动力学研究方面，创建了国内领先、国际先进的肝脏CYP450药物代谢的体外研究技术平台，对CYP450的生理和病理进行了系统研究，证明CYP450基因多态性以及酶含量对药物代谢影响的有限性，为指导临床个体化用药奠定了基础。在肿瘤等炎症相关疾病研究方面，发现肝癌患者肝CYP450各亚型代谢活性改变不一，有的降低，有的不变，有的增高；发现CYP2E1为炎症反应中的新靶点，证明其与肿瘤等炎症相关性疾病的发生发展有关，并研发了CYP2E1特异性抑制剂。上述研究得到了重大新药创制国家科技重大专项和6项国家自然科学基金项目的资助，所创制的国家1.1类抗脑缺血新药正在进行临床研究，相关研究成果已被编入人民卫生出版社出版的研究生教材《高级药理学》中。
近年来，共发表研究论文近200篇，其中SCI论文60余篇，包括JCR一区论文20余篇；出版著作20余部，包括主编了国家规划教材《临床药理学》（第一版、第二版），主持获得河南省科技进步二等奖3项等。
