《Nature Communications》: 中国肿瘤人群癌基因突变频率

20229月,我院董子钢教授团队通过对中国全癌症谱的基因组学数据与中国肿瘤流行病学数据进行融合分析,首次得到中国肿瘤人群癌症相关基因突变频率,然后与美国数据比对分析,发现中美两国的TP53EGFR等基因突变频率存在较大差异,并对相关原因进行了分析。本研究对我国肿瘤研究领域开展精准靶向治疗具有重要指导意义,并在国际知名杂志《Nature Communications(自然通讯)发表了题为“The comparison of cancer gene mutation frequencies between China and U.S.”的学术论文。郑州大学博士研究生马法洋为论文第一作者,博士后Laster K.为重要作者,董子钢教授为通讯作者。

该研究共收集汇总了2004年至2016年中国国家癌症中心556万的肿瘤流行病学数据,同时纳入分析23种癌症类型(94种亚型,11,948例癌症患者),得到382个癌基因的突变率。通过把癌基因组学数据与肿瘤流行病学数据进行融合分析,得出中国肿瘤人群排名前十的突变基因为TP53(51.4%)LRP1B(13.4%)PIK3CA(11.6%)KRAS(11.1%), EGFR(10.6%), APC(10.5%), KMT2D(9.7%), KMT2C(8.8%), ARID1A(8.4%), and FAT4(7.7%)。其中突变频率最高的基因为TP53(51.4%),即超过一半的肿瘤患者的癌组织带有TP53突变。另外,通过对中国与美国的癌症基因突变频率进行对比分析发现,中国肿瘤患者TP53(51.4%) EGFR (10.6%) 癌基因的突变频率要远高于美国的TP53(34.0%) EGFR (3.1%)突变频率。进一步分析发现TP53的突变频率差异主要是来原于中国肿瘤人群中的非小细胞肺癌,胃癌,食管癌,及肝癌中TP53的高突变率(图1)。同时本研究通过对性别及吸烟与否进行分层分析,发现中美两国人群EGFR基因突变频率差异主要来自于中国肺癌人群的EGFR高突变率,其中中国肺癌患者中非吸烟女性的EGFR的突变频高达70.7%。该研究报道了11,948例中国肿瘤患者癌基因突变的总体情况,绘制了迄今为止中国人群中规模最大、最全面的癌基因突变图谱,并全面比较分析中美两国肿瘤人群癌基因突变谱的差异,该研究明确了我国肿瘤人群独特的基因突变谱,为我国科研工作者开展针对肿瘤患者高频基因突变的精准靶向治疗,提供了重要的理论基础与指导方向。


                                              

1. 中美两国肿瘤人群高突变癌基因比对分析

Nature Communications》是Nature最具影响力的综合性子刊,所刊发论文对癌症研究具有重要的引领和指导作用。

该研究得到国家自然科学基金(No.82073075)和河南省科技厅重大科技专项(No.221100310100)的资助。

文章链接:https://doi.org/10.1038/s41467-022-33351-4