啮齿动物低氧适应与鸟类情绪调控

国家级专家、中原科技创新领军人才，教授，博导、硕导

wzl@zzu.edu.cn

教育背景

2002.09-2005.06  中国科学院动物研究所，博士

1995.09-1998.08  中国科学院西北高原生物研究所，硕士

1991.09-1995.05  兰州大学，本科

工作经历

2008.10-至今    郑州大学生命科学学院，教授

2005.11-2009.10  中国科学院西北高原生物研究所，博士后

1998.09-2008.10  曲阜师范大学生命科学学院，教师、副教授

成果与奖励

一、文章发表

在国内外核心期刊发表科技论文120多篇，重要的文章有：

1) 比较基因组分析18种哺乳动物全基因组，揭示了地下哺乳动物的适应性进化(ECOL EVO, L2020)。

2) 空间转录组和单细胞核转录组探索斑胸草雀和鸽子脑OT区细胞组织和分子特征（ISCIENCE, 2024）。

3) 转录组测序分析揭示两盲鼹鼠种群的同域分化（PNAS, 2016a）、非洲刺鼠物种分化与形成（PNAS, 2016b）、棕色田鼠脑组织低氧适应机制（FRONT ZOOL, 2020; BMC genome, 2018）、青海田鼠和布氏田鼠肺低氧适应机制(SCI TOTAL ENVIRON, 2023)、布氏田鼠和青海田鼠心脏低氧适应机制（ZR, 2022）。

4) 转录组和代谢组联合分析揭示骨骼肌低氧适应机制(SCI TOTAL ENVIRON, 2021)。

5) 神经组织原位杂交技术与qPCR技术揭示棕色田鼠和布氏田鼠生物钟调控机制(CHRONOBIOL INT, 2020; INT J BIOL MACROMOL, 2017, 2018)。

6) 动物低氧响应蛋白质数据库iHypoxia（Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2023）、蛋白质翻译后修饰定量数据库qPTMplants（Nucleic Acids Research, 2022）。

二、科研项目

1）国家自然基金面上项目、地区培育与主任基金合计3项，总经费142万元；

2）主持国家其他项目7项（总经费1005万元），参加项目（第二位）3项（总经费830万元）。

3）中原科技创新领军人才等省级人才项目2项，总经费135万元。

三、科技奖励

1）河南省科技进步二等奖，地下鼠低氧适应分子机制及其抗癌特性研究，2018

2）河南省教育厅教学成果二等奖（研究生教育），生物学研究生创新课程体系建设与实践，2019

3）教育部学位与研究生教育全国第十四届中国研究生竞赛（地区赛）一等奖，基于机器视觉的心率测量装置，2019

研究方向

课题组主要以地下鼠及其近缘物种、鸽子和斑胸草雀为对象，生理生态学、分子生物学、比较基因组学、比较转录组学、蛋白质组学和代谢组学等方法，研究地下鼠对地下洞道生活的低氧、黑暗等环境特征的适应与进化机制。鸽子情绪和运动调控的神经机理和分子机制。具体包括：

1.啮齿动物对于地下洞道系统与高原环境的低氧适应与进化。以毛足田鼠属的3个姊妹种，即布氏田鼠、青海田鼠和棕色田鼠为研究对象，采用比较基因组学、比较转录组学、蛋白质及其翻译后修饰、代谢组学等方法，精细地比较研究啮齿动物对于地下洞道系统和高原环境的低氧适应与进化机制，课题组尤其关注脑组织对于缺氧环境的应答机制。

2.基于三代测序分析的地下鼠进化研究。以几种鼢鼠和竹鼠为研究对象，采用比较基因组学的系统发育、基因家族扩张与收缩、基因进化速率分析、遗传图谱构建和趋同进化分析等，研究其对地下洞道系统进化机制。

3.鸽子情绪和运动神经机制研究。以鸽子为研究对象，采用神经示踪技术、神经组织染色方法、光遗传学方法等，利用神经生理学和生物电子手段研究鸽子的愉悦、恐惧等情绪的神经通路及其调控机理。

此外，还关注几种河南道地药材有效成分的表达调控机制。

其他

代表性文章

1) Liao K., Xiang Y., Huang F., Huang M., Xu W., Lin Y., Liao P., Wang Z., Yang L, Tian X, Chen D, Wang Z.*, Liu S.*, Zhuang Z*. Spatial and single-nucleus transcriptomics decoding the molecular landscape and cellular organization of avian optic tectum.[J] ISCIENCE (2024), doi: https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109009. B期刊，二区，IF=5.8

2) Li X., Li M., Huang M., Li J., Huang S., Wang B., Gao Y., Wang Z.,* Shi L.* Hypoxic response patterns in lung tissue: An integrated analysis of comparative physiological and transcriptomic studies from Neodon fuscus and Lasiopodomys brandtii.[J] Science of The Total Environment, 2023, 892(2023):164537. IF=9.8）A期刊，一区，IF=9.8

3) Liu Z., Wang P., Zhang Q., Li S., Zhang Y., Guo Y., Jia C., Shao T., Li L., Cheng H.*, Wang Z.* iHypoxia: an integrative database of the expression dynamics of proteins in response to hypoxia in animals.[J] Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 21(2023):267-277. A期刊，一区，IF=9,5

4) Li X., Qiao C., Chen B., Li M., Chen P., Huang M., Chen C., Liu Y., Cheng H., Jiang M., Shi L.*,Wang Z.*. Fuel source shift or cost reduction:Context-dependent adaptation strategies in closely related Neodon fuscus and Lasiopodomys brandtii against hypoxia.[J] Zoological research, 2022(004):043. A期刊，一区，IF=4.9

5) Shi L., Chen B., Wang X., Huang M., Qiao C., Wang J., Wang Z.* Antioxidant response to severe hypoxia in Brandt's vole Lasiopodomys brandtii.[J] Integrative zoology, 2022, 17(4):581-595. A期刊，一区，IF=3.3

6) Li M., Tian X., Li X., Huang M., Huang S., Wu Y., Jiang M., Shi Y., Shi L.*, Wang Z.* Diverse energy metabolism patterns in females in Neodon fuscus, Lasiopodomys brandtii, and Mus musculus revealed by comparative transcriptomics under hypoxic conditions.[J] Science of The Total Environment, 783(2021):147130. A期刊，一区，IF=10.753

7) Wang P., Zhang Q., Li S., Cheng B., Xue H., Wei Z., Shao T., Liu Z., Cheng H*., Wang Z. iCysMod: an integrative database for protein cysteine modifications in eukaryotes.[J] Briefings in bioinformatics, 2021, 22(5). A期刊，一区，IF=9,5 

8) Dong Q., Wang Z., Jiang M., Sun H., Wang X., Li Y., Zhang Y., Cheng H., Chai Y., Shao T., Shi L.*, Wang Z.* Transcriptome analysis of the response provided by Lasiopodomys mandarinus to severe hypoxia includes enhancing DNA repair and damage prevention.[J] Frontiers in Zoology, 2020, 17(1). A期刊，一区，IF=3.172

9) Li K.*, Wang L., Knisbacher B. A., Xu Q., Levanon E. Y., Wang H., Frenkel-Morgenstern M., Tagore S., Fang X., Bazak L., Buchumenski I., Zhao Y., Lövy M., Li X., Han L., Frenkel Z., Beiles A., Cao Y.*, Wang Z*, Nevo E*. Transcriptome, genetic editing, and microRNA divergence substantiate sympatric speciation of blind mole rat, Spalax. [J] Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2016(27):113.（A期刊，一区，IF=9.661）

10) Li K.*, Wang H., Cai Z., Wang L., Xu Q., Lövy M., Wang Z.*, Nevo E.* Sympatric speciation of spiny mice, Acomys, unfolded transcriptomically at Evolution Canyon, Israel.[J] Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113(29):8254-9.（A期刊，一区，IF=9.661）

国内外学术团体任职或兼职