依据《中国共产党章程》、《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》，结合学院实际工作，化学学院党委下设教工党支部10个、研究生党支部10个、本科生党支部5个。

学院党委认真落实教育部“对标争先”建设计划和“双带头人”培育工程，结合学院基层学术与教学组织改革，2020年进行了教工党支部重组和换届选举，并按“双带头人”的标准和要求配备了教工党支部书记。学院学生党支部的设立立足于学院向研究型院系转型的实际，实行多维度构建模式，将学术、科研与党建工作进行紧密结合，形成年级式党支部、专业式党支部、课题组式党支部等多种模式，做到全方位覆盖，进一步激发党支部的活力。

近年来，学院党建工作取得了良好成绩。2018年郑州大学化学学院入选教育部首批“三全育人”综合改革试点院系，有机学科教工党支部入选教育部首批“全国党建工作样板支部”，博士生第一党支部入选教育部首批全国高校“百个研究生样板党支部”。2020年，有机学科教工党支部顺利通过“全国党建工作样板支部”验收。2021年11月，学院完成教育部“三全育人”综合改革试点院系结项。2021年5月，“郑大化学”微信公众号入选中央宣传部、中央网信办、教育部、共青团中央“首批高校思政类公众号重点建设名单”。