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杨龙华

杨龙华

博士,副教授,硕士生导师

邮箱:yanglh@zzu.edu.cn

研究方向:主要致力于计算机药物分子设计的方法和应用研究,计算化学生物学,大分子复杂体系的多尺度动态模拟研究。

1)基于结构和机理的计算机药物设计;

2)药物-靶标相互作用机制的多尺度分子模拟;

3)基于人工智能的药物设计;

4)分子模拟力场和药物设计算法的开发和应用。


个人简介

河南大学化学/计算机双学士学位,2016年博士毕业于南昌大学,美国加州大学圣地亚哥分校(University of California, San Diego)国家公派联合培养博士。2017年进入郑州大学药学院药物化学系工作。主要承担本院及留学生本科药物化学等多门理论及实验课程的讲授。先后主持国家级自然科学青年基金、省级科技攻关、校级科研项目等5项,横向项目1项,教改项目2项;参与多个国家和省级重点及面上项目,一流课程建设及教改、思政项目,指导大创项目多项。在J.Med.Chem.,ChemsusChem,BBA-Bioenergetics,Phys. Chem. Chem. Phys.等多个学术期刊上发表SCI论文20余篇。受邀担任Molecules, Front. Mol. Biosci.等多个学术期刊审稿人。郑州大学优秀班主任,毕业生就业工作先进工作者。


教学与教研:

主要担任本科生及留学生的《药物化学》、《有机化学反应实验》、《天然药物化学实验》课程教学。指导多项省级、校级研究生/本科生大学生创新创业项目,国药大创项目。主持或参与多项省级、校级教改项目、一流课程建设及思政项目等。部分代表教改项目:

1)“互联网+教育”下留学生药物化学课程中教学模式和思政教育的研究和探索,2022,校级重点项目,主持;

2)基于现代信息技术的计算机辅助药物设计教学模块研究与实践,2022,校级,主持;

3)河南省本科高校药学专业课思政教学研究特色化示范中心,2022,省级重大项目,参与;

4)"新医科"背景下多学科交叉融合的药物化学人才培养模式探索与实践,2021,校级重大项目,参与。


科研项目:

1)基于TNFα-TNFR1的核酸适配体和多肽抑制剂计算机药物设计与生物活性评价,河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目,2023-2024,主持;

2)B类型细胞色素c氧化酶质子泵作用机制的分子动力学模拟研究,国家自然科学青年基金项目,2019-2021,主持;

3)药物设计软件程序包在国产S758IT型服务器上的优化与测试,郑州大学青年人才企业合作创新团队项目,2022,主持;

4)LSD1与非组蛋白底物大分子的相互作用机制研究,河南省博士后科研项目二等资助,2019,主持;

5)药物设计软件程序包在GPU计算服务器上的优化与测试,横向项目,2024,主持;

6)HDAC6及SHP2对食管癌逃逸的表观遗传调控及其靶向小分子抑制剂干预研究,国家自然科学基金联合基金项目-重点支持项目,2022-2025,参与;

7)USP7对胃癌细胞转移、增殖和免疫逃逸的调节机制及小分子化合物干预研究,国家自然科学基金重点国际(地区)合作研究项目,2021-2025,参与。


研究与成果

近期部分代表性论文:

1)X. Dai#, L. Zhao#, L. Yang#, T. Guo, L. Xue, H. Ren, Z. Yin, X. Xiong, Y. Zhou, S. Ji, H. Liu, H. Liu*, Y. Liu*, Y. Zheng*; Phenothiazine-based LSD1 inhibitor promotes T-Cell killing response of gastric cancer cells, J. Med. Chem., 2023, 66(6): 3896-3916;

2)X. Yang, S. Liu, Z. Yin, M. Chen, J. Song, P. Li, L. Yang*; New insights into the proton pumping mechanism of ba3 cytochrome c oxidase: the functions of key residues and water, Phys. Chem. Chem. Phys., 2023, 25(37): 25105-25115;

3)Z. Yin, S. Liu, X. Yang, M. Chen, J. Du, H. Liu, L. Yang*; LSD1-based reversible inhibitors virtual screening and binding mechanism computational study, Molecules, 2023, 28(14): 5315-5335;

4)C. Wang, Z. Ma, X. Hou, L. Yang*, Y. Chen*; Research and Application of NTs Cyanamides in Organic Synthesis, Chinese J. Org. Chem., 2023, 43(1):74;

5)X. Chu, X. Du, L. Yang, Z. Wang, Y. Zhang, X. Wang, L. Dai, J. Zhang, J. Liu, N. Zhang*, Y. Zhao*, H. Gu*; Targeting Tumor Necrosis Factor Receptor 1 with Selected Aptamers for AntiInflammatory Activity, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2023, 15(9):11599-11608;

6)L. Dai, J. Zhang, X. Wang, X. Yang, F. Pan, L. Yang*, Y. Zhao*; Protein DEK and DTA aptamers: insight into the interaction mechanisms and the computational aptamer design, Front. Mol. Biosci., 2022, 9: 946480-946494;

7)Y. Yao, T. Huang, Y. Wang, L. Wang, S. Feng, W. Cheng, L. Yang*, Y. Duan*; Angiogenesis and anti-leukaemia activity of novel indole derivatives as potent colchicine binding site inhibitors, J. Enzym. Inhib. Med. Ch., 2022, 37(1): 652-665;

8)T. Wang, W. Zhao, S. Li, H. Yao, Q. Zhang*, L. Yang*; Characterization of erm(B)-carrying Campylobacter Spp. Of retail chicken meat origin, J. Glob. Antimicrob. Re., 2022, 30:173-177;

9)L. Yang, Å. A. Skjevik, W. G. H. Du, L. Noodleman, R. C. Walker, A. W. Götz, Water exit pathways and proton pumping mechanism in B-type cytochrome c oxidase from molecular dynamics simulations, BBA-Bioenergetics., 2016, 1857(9), 1594-1606;

10)L. Yang, H. Wang*, Recent Advances in Carbon Dioxide Capture, Fixation, and Activation by using N-Heterocyclic Carbenes, ChemSusChem, 2014, 7(4), 962-968.

专利:

赵永星; 王肖楠; 代丽君; 孙朋超; 张译; 杨龙华; 一种核酸适配体和多肽交联的双靶点复合核酸纳米药物制备方法与应用, 2023-05-09, 中国, CN202210486576.8.



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