多组学联合分析和数据库构建

讲师

Mengyuanyang@zzu.edu.cn

教育背景

2016.09 -2021.05 同济大学 生物学-生物信息学 博士

2012.09-2016-06 郑州大学 生物信息学 学士

研究经历

2018.11-2021.03 UThealth 生物信息学 访问学者

2021.10-至今  郑州大学生命科学学院 讲师

主要成果与奖励

1. Liu, J., Yang, M., Zhao, W. and Zhou, X., 2022. CCPE: cell cycle pseudotime estimation for single cell RNA-seq data. Nucleic acids research, 50(2), pp.704-716.

2.Yang, M*., Lu, H*., Liu, J., Wu, S., Kim, P. and Zhou, X., 2022. lncRNAfunc: a knowledgebase of lncRNA function in human cancer. Nucleic acids research, 50(D1), pp.D1295-D1306.

3. Kim, P., Tan, H., Liu, J., Yang, M. and Zhou, X., 2021. FusionAI: predicting fusion breakpoint from DNA sequence with deep learning. Iscience, 24(10), p.103164.

4. Yang, M., Ke, Y., Kim, P. and Zhou, X., 2021. 6.ExonSkipAD provides the functional genomic landscape of exon skipping events in Alzheimer’s disease. Briefings in Bioinformatics, 22(5), p.bbaa438.

5. Wu, S., Yang, M., Kim, P. and Zhou, X., 2021. ADeditome provides the genomic landscape of A-to-I RNA editing in Alzheimer’s disease. Briefings in Bioinformatics, 22(5), p.bbaa384.

6.Kim, P*., Yang, M*., Yiya, K., Zhao, W. and Zhou, X., 2020. ExonSkipDB: functional annotation of exon skipping event in human. Nucleic acids research, 48(D1), pp.D896-D907.

研究方向

主要研究方向为癌症/阿尔兹海默症多基因组学联合分析，一直致力于生物大数据整合分析，以及深度学习建模等生物信息学和计算生物学领域的研究。具体研究内容包括癌症基因组中lncRNA和外显子跳跃事件生物标记的筛选等癌症基因组学领域，阿尔兹海默症中可变剪接的功能注释等脑科学领域，以及算法设计、统计模型构建、深度学习方法开发等数据挖掘领域。目前主要从事基于高通量测序数据的脑科学以及癌症组学研究。