病理生理学系是河南省医学类唯一的国家重点（培育）学科，郑州大学 “肿瘤防治与转化医学”一流学科和河南省 “肿瘤防治”特色优势学科的重要支撑学科。

病理生理学系历史悠久，前身为河南医学院病理生理学教研室，1954年由李光泽老师和刘桂亭老师等开始筹建，于1956年正式成立，由沈琼老师、陈少如老师、刘桂亭老师、高保罗老师承担授课任务。2000年河南医科大学与郑州大学、郑州工业大学合并，病理生理学教研室更名为郑州大学基础医学院病理生理学教研室，2015年由病理生理学教研室改为病理生理学系。2020年原基础肿瘤教研室并入病理生理学系。

病理生理学系是国务院学位办首批硕士学位授予点；病理学与病理生理学为二级学科的博士学位授予点；河南省首批博士后流动站。1988年获批河南省重点学科，河南省教育厅“211”工程培育学科（1995年、2009年），2007年被获批为国家重点（培育）学科。病理生理学科是癌症化学预防河南省协同创新中心、河南省癌症化学预防国际联合研究中心、河南省癌症化学预防工程研究中心和省部共建食管癌防治国家重点实验室主要依托单位。也是郑州大学基础医学院科研实验中心、河南省高等学校肿瘤生物治疗重点学科开放实验室、河南省应用基础医学重点学科开放实验室所在地。

病理生理学系教师总数24人。其中教授8人，副教授9人，具有博士研究生学历23人，具有出国留学经历10人，博士生导师5人，硕士生导师21人。学科有俄罗斯工程院外籍院士和欧洲科学院外籍院士1人，教育部新世纪人才1人，河南省学科特聘教授4人，河南省学术技术带头人4人，河南省高校创新人才4人，中原科技创新领军人才1人，河南省教学名师2人，中原教育教学领军人才1人，河南省高等学校青年骨干教师3人。在研国家级项目20余项。《病理生理学》课程分别获批国家级线上线下混合式一流课程、河南省线上一流本科课程、河南省线上线下混合式一流本科课程。病理生理学系获批河南省优秀基层教学组织称号。病理生理学系所在党支部和工会分别获得“河南省高等学校先进基层党组织”荣誉称号和“河南省优秀女工组织”荣誉称号。

系现任领导：系学术带头人：刘康栋 （博士 教授 博士生导师）

        系党支部书记：赵继敏 （博士 副教授 硕士生导师）

        系党支部副书记：莫赛军（博士 副教授 硕士生导师）

                系主任： 路静 （博士 教授 博士生导师）